Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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MKRN4PQ13434 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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MKRN4PQ13434 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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MKRN4PQ13434 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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