Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms