Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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SNTA1Q13424 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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SNTA1Q13424 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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SNTA1Q13424 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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