Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms