Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.3 ms