Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP17L18D6R9N7 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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