Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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LHX9Q9NQ69 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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LHX9Q9NQ69 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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LHX9Q9NQ69 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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LHX9Q9NQ69 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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LHX9Q9NQ69 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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LHX9Q9NQ69 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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