Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms