Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM46AQ96IP4 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM46AQ96IP4 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms