Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms