Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
WDR44Q5JSH3 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms