Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
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RTL8BQ17RB0 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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