Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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