Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIF1AQ16665 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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