Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ALX1Q15699 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ALX1Q15699 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms