Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PCOLCEQ15113 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms