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| BRD3 | Q15059 | SNORA24.1-201 | ENST00000384401 | 135 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
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| BRD3 | Q15059 | DAZ4-201 | ENST00000382296 | 2048 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | DOCK7-201 | ENST00000251157 | 7084 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | ADGRL2-207 | ENST00000370723 | 5254 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | ATF2-204 | ENST00000409437 | 3697 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC103993.1-201 | ENST00000521500 | 1584 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | PKN2-AS1-202 | ENST00000458097 | 3542 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | PRKACB-217 | ENST00000610457 | 4206 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC012254.1-201 | ENST00000592747 | 200 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
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| BRD3 | Q15059 | FP236240.3-201 | ENST00000623061 | 327 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | WRN-201 | ENST00000298139 | 5215 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | RGS13-204 | ENST00000543215 | 1518 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNMT-206 | ENST00000589866 | 1879 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | SYNE2-212 | ENST00000554584 | 20508 nt | TSL 5 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | MGST1-207 | ENST00000535309 | 1331 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNA5SP383-201 | ENST00000362934 | 120 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-778P-201 | ENST00000363269 | 103 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-1097P-201 | ENST00000363586 | 107 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR30B-201 | ENST00000384850 | 88 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL663109.1-201 | ENST00000411498 | 844 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00301-202 | ENST00000412599 | 772 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | SDCBPP3-201 | ENST00000419629 | 891 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC083900.1-201 | ENST00000421964 | 469 nt | TSL 2 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC090952.1-201 | ENST00000424242 | 446 nt | TSL 3 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC074327.1-201 | ENST00000448017 | 540 nt | TSL 2 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC126389.1-201 | ENST00000477436 | 290 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SL323P-201 | ENST00000494712 | 295 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | PTPRG-AS1-210 | ENST00000498655 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC010265.1-201 | ENST00000513509 | 211 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU2-27P-201 | ENST00000516185 | 142 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-579P-201 | ENST00000516879 | 102 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC022360.2-202 | ENST00000517308 | 407 nt | TSL 3 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | SMIM18-201 | ENST00000517349 | 905 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL845331.3-202 | ENST00000562856 | 261 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SL703P-201 | ENST00000578485 | 302 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |