Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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BRD3Q15059 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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BRD3Q15059 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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BRD3Q15059 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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BRD3Q15059 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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BRD3Q15059 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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BRD3Q15059 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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