Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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