Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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