Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE1CQ14123 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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