Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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COL9A2Q14055 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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COL9A2Q14055 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
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COL9A2Q14055 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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COL9A2Q14055 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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COL9A2Q14055 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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COL9A2Q14055 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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COL9A2Q14055 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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