Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCINQ13939 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142 ms