Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PMS2P11Q13670 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PMS2P11Q13670 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms