Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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