Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ITGB3BPQ13352 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms