Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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RPA4Q13156 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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RPA4Q13156 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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RPA4Q13156 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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RPA4Q13156 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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