Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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TRAF3Q13114 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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TRAF3Q13114 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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TRAF3Q13114 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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TRAF3Q13114 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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TRAF3Q13114 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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TRAF3Q13114 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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TRAF3Q13114 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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