Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRDNQ13061 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms