Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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SMARCB1Q12824 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SMARCB1Q12824 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SMARCB1Q12824 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SMARCB1Q12824 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SMARCB1Q12824 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SMARCB1Q12824 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SMARCB1Q12824 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SMARCB1Q12824 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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