Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 WDR7-202ENST00000357574 7213 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 CEACAM6-201ENST00000199764 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 PDIK1L-201ENST00000374269 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 CTAGE3P-201ENST00000454280 2404 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RN7SL715P-201ENST00000606972 286 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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