Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
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