Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FAM53CQ9NYF3 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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