Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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