Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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