Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 CICP10-201ENST00000439497 198 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RN7SL239P-201ENST00000490061 300 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC006115.1-201ENST00000599726 517 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms