Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms