Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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