Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
USF2Q15853 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
USF2Q15853 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
USF2Q15853 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
USF2Q15853 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USF2Q15853 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
USF2Q15853 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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