Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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