Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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SYCP1Q15431 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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SYCP1Q15431 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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SYCP1Q15431 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SYCP1Q15431 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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SYCP1Q15431 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SYCP1Q15431 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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