Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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CNN3Q15417 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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CNN3Q15417 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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