Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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