Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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UBE4AQ14139 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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UBE4AQ14139 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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UBE4AQ14139 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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UBE4AQ14139 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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UBE4AQ14139 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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UBE4AQ14139 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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