Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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