Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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PDE7AQ13946 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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PDE7AQ13946 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDE7AQ13946 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PDE7AQ13946 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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