Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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SHROOM2Q13796 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
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SHROOM2Q13796 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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SHROOM2Q13796 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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SHROOM2Q13796 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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SHROOM2Q13796 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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SHROOM2Q13796 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHROOM2Q13796 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHROOM2Q13796 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHROOM2Q13796 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHROOM2Q13796 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHROOM2Q13796 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHROOM2Q13796 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHROOM2Q13796 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHROOM2Q13796 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHROOM2Q13796 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHROOM2Q13796 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHROOM2Q13796 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHROOM2Q13796 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHROOM2Q13796 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHROOM2Q13796 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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