| RUNX3 | Q13761 | AC116347.2-201 | ENST00000514912 | 523 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DEFB130C-201 | ENST00000528518 | 237 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TAS2R43-201 | ENST00000531678 | 1027 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018630.1-201 | ENST00000541376 | 925 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02562-201 | ENST00000561705 | 785 nt | TSL 2 BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF861P-201 | ENST00000588126 | 639 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL451064.1-201 | ENST00000607718 | 471 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010678.1-201 | ENST00000614118 | 713 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092140.2-201 | ENST00000618027 | 521 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC105265.4-201 | ENST00000618391 | 306 nt | TSL 5 BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMIM2-AS1-204 | ENST00000619472 | 746 nt | TSL 3 BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZRANB2-AS2-222 | ENST00000625045 | 1014 nt | TSL 5 BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4P4-201 | ENST00000439033 | 1366 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAPPC13-204 | ENST00000438419 | 1437 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCT4P2-201 | ENST00000233836 | 1548 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | SYT14-204 | ENST00000472886 | 2966 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC6A15-202 | ENST00000309283 | 3108 nt | TSL 5 BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BIRC3-206 | ENST00000532808 | 4238 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIAA1107-202 | ENST00000636278 | 4065 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FGF7P2-201 | ENST00000332473 | 296 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU5F-7P-201 | ENST00000363696 | 115 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.194-201 | ENST00000363985 | 102 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-853P-201 | ENST00000364306 | 107 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-297P-201 | ENST00000384636 | 107 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL138880.1-201 | ENST00000405824 | 642 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NT5C3A-205 | ENST00000409467 | 1032 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB3P23-201 | ENST00000414981 | 585 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAD23BP2-201 | ENST00000416003 | 1207 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104777.3-201 | ENST00000416350 | 545 nt | TSL 3 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OOSP1P1-201 | ENST00000423265 | 274 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093843.1-201 | ENST00000424395 | 512 nt | TSL 2 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NAALADL2-AS1-201 | ENST00000426315 | 804 nt | TSL 5 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356583.2-201 | ENST00000426536 | 280 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC023590.1-204 | ENST00000434023 | 431 nt | TSL 5 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P36-201 | ENST00000444633 | 681 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL513328.1-201 | ENST00000446460 | 224 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS24P6-201 | ENST00000452670 | 400 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01546-201 | ENST00000457435 | 674 nt | TSL 2 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-956P-201 | ENST00000458868 | 103 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GPX5-203 | ENST00000469384 | 428 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P5-201 | ENST00000471472 | 736 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB3P15-201 | ENST00000507326 | 574 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC034234.1-202 | ENST00000508696 | 339 nt | TSL 3 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC117460.1-201 | ENST00000508964 | 467 nt | TSL 3 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FABP5P5-201 | ENST00000515537 | 406 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA31.20-201 | ENST00000517111 | 133 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CR383656.7-201 | ENST00000548164 | 174 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091534.1-202 | ENST00000549953 | 468 nt | TSL 5 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC066612.2-201 | ENST00000559875 | 695 nt | TSL 2 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC234778.2-201 | ENST00000566241 | 354 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138625.1-201 | ENST00000567556 | 483 nt | TSL 3 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AGGF1P4-201 | ENST00000568249 | 801 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005951.1-201 | ENST00000576706 | 485 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC037487.2-201 | ENST00000581796 | 537 nt | TSL 3 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3611-201 | ENST00000584484 | 83 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC083760.1-201 | ENST00000589621 | 670 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068276.1-201 | ENST00000605793 | 379 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090115.4-201 | ENST00000609970 | 188 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMEM154-204 | ENST00000613578 | 486 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590099.1-201 | ENST00000615276 | 138 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR6817-201 | ENST00000615588 | 66 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC002550.2-201 | ENST00000621246 | 394 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092656.1-203 | ENST00000624134 | 423 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL603839.4-201 | ENST00000624658 | 1005 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01002-202 | ENST00000631412 | 459 nt | TSL 5 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093591.3-201 | ENST00000634516 | 308 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CRYM-AS1-204 | ENST00000637983 | 556 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EXOC6-203 | ENST00000371552 | 3564 nt | TSL 5 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CC2D2B-210 | ENST00000636965 | 3247 nt | TSL 5 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VNN1-201 | ENST00000367928 | 3106 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR26A1-201 | ENST00000362205 | 77 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA7.2-201 | ENST00000364446 | 145 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU5E-5P-201 | ENST00000365379 | 116 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAV8-1-201 | ENST00000390430 | 473 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004870.3-202 | ENST00000412996 | 432 nt | TSL 3 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL17P12-201 | ENST00000413391 | 526 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC000123.1-201 | ENST00000418215 | 516 nt | TSL 5 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001136.1-201 | ENST00000425058 | 635 nt | TSL 2 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DPPA2P1-201 | ENST00000428060 | 556 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC020571.1-201 | ENST00000430904 | 768 nt | TSL 2 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC017048.2-201 | ENST00000431455 | 822 nt | TSL 3 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP22-201 | ENST00000437556 | 453 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL354977.1-201 | ENST00000438147 | 679 nt | TSL 5 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB1P12-201 | ENST00000438594 | 598 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL359636.3-201 | ENST00000439471 | 301 nt | TSL 2 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NFIA-AS1-201 | ENST00000442027 | 384 nt | TSL 2 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM103A2P-201 | ENST00000444122 | 354 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL592447.1-201 | ENST00000447592 | 540 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FTH1P25-201 | ENST00000447665 | 469 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SIDT1-AS1-201 | ENST00000462180 | 465 nt | TSL 3 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL21P104-201 | ENST00000464143 | 478 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012181.1-201 | ENST00000479895 | 423 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021382.1-201 | ENST00000483523 | 359 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SRI-210 | ENST00000490437 | 570 nt | TSL 2 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC034222.1-201 | ENST00000494052 | 532 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096751.1-202 | ENST00000502691 | 1067 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |