Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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