Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRQ13535 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ATRQ13535 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ATRQ13535 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ATRQ13535 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ATRQ13535 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ATRQ13535 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ATRQ13535 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRQ13535 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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