Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms