Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ATMQ13315 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
ATMQ13315 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ATMQ13315 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.29
ATMQ13315 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.29
ATMQ13315 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATMQ13315 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATMQ13315 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATMQ13315 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATMQ13315 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATMQ13315 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATMQ13315 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATMQ13315 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATMQ13315 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATMQ13315 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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